圆柏是一种很好的园林植物，有着较为不错观赏价值和园林价值，在很多园林都有种植。一般很少有病害，但是一旦发生病害需要及早防治。
1、病害
圆柏梨锈病、圆柏苹果锈病及圆柏石楠锈病，这些都是越冬寄主，冬季要注意预防和查杀，尽量在冬季清理枝叶，以免虫卵越冬。在建筑外侧种植圆柏，可使此地在寒冷的冬季也有景色可赏。
2、预防
5月份喷洒1%等量式波尔多液，或80%的素402的100倍液，可以起到防治病虫害的目的。进入冬季之后，要对林间进行合理的疏伐，及时将危害的林木去除，确保整个林分结构密度，适宜加强林间通风透光。
3、造林
在林间栽培管理过程中，做好枯枝清理工作，注重清理祁连圆柏树冠上的枯枝落叶，收集之后带出林间进行集中处理。
4、盆栽
圆柏盆栽养殖每隔3到4年需要对它翻一次盆，翻盆在多雨季进行，在翻盆的时候适当去掉一部分老根，换掉一半的宿土，加入一点肥沃疏松的砂质培养土。