一、病害
1、马蹄莲软腐病：植株接近地表处发生软腐脱离，向上引起叶片枯萎，向下引起肉质块茎产生黍上骨性软腐，根也腐烂，整株突然萎蔫而死亡。叶片边缘受害，变软湿腐。花梗受侵害，花变褐色，花梗软腐脱落，细菌性病害。
防治方法：
（1）采收时，剔除病球茎，用40%甲醛55液倍液处理1小时晾干后存放。
（2）发现病株及时拔除烧毁，并在病株周围用40%甲醛40倍液消毒土壤。
（3）块茎种植深度不超过5厘米，避免过度供水。
2、马蹄莲叶斑病：有3种真菌引起马蹄莲叶斑病，其中以叶点霉发生较为普遍，初期，叶上病斑小，近圆形，灰白色，逐渐扩展联合呈不规则大片烂斑，有时亦侵害花和花梗。
防治方法：
（1）及时清除病叶残基，避免过度供水。不要直接向植株浇灌。
（2）发病时喷25%敌力脱乳油1000—1500倍液，或80%大生500倍液，隔7—15天喷1次，连续2—3次。
3、马蹄莲病毒病：马蹄莲病毒表现有两种症状，花叶症状为病株叶片表现典型花叶，叶片缩小扭曲畸形，白斑或称环斑症状，是在叶脉附近出现褪绿环斑或条纹，叶扭曲，小花梗上呈现白点，花蕾上有浅色斑点花畸形，花叶病可由汁液，桃蚜传播。
防治方法：
（1）选用无病母株养殖，生长期发现病株及时拔除烧毁。
（2）在马蹄莲整个生长期，用50%马拉松1000倍液或2.5%溴氰菊脂乳油3000倍液防治蚜虫，蓟马等传毒介体。
二、虫害
二点叶螨：别名棉红蜘蛛，寄主有向日葵、马蹄莲、月季、桃、文竹、腊梅、孔雀草、木槿、玫瑰等。二点叶螨在叶背吸取叶片汁液，轻则叶片变红，如火烧，重则落叶。
防治方法：
（1）摘除有病叶片，并集中处理。
（2）喷40%三氯杀螨醇1000倍液，或20%好年冬2000倍液，或25%爱卡士1500倍液。